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1.
Arq. neuropsiquiatr ; 81(1): 62-73, Jan. 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1429875

ABSTRACT

Abstract Background Pharmacogenetics promises better control of diseases such as cardiovascular disease (CVD). Acetylsalicylic acid, aspirin, prevents the formation of an activating agent of platelet aggregation and vasoconstriction, and it is used to prevent CVD. Nevertheless, patients may have treatment failure due to genetic variants that modify the metabolism of the drug causing aspirin resistance (AR). Objectives To realize a systematic literature review to determine the impact of genetic variants on AR. Methods Articles published in the MEDLINE/PubMed, Cochrane, Scopus, LILACS, and SCIELO databases were systematically screened. A total of 290 articles were identified and 269 articles were excluded because they did not comply with the previously established inclusion criteria. A total of 20 case-control studies and 1 cohort was included. Results The genetic variants rs1126643 (ITGA2), rs3842787 (PTGS1), rs20417 (PTGS2), and rs5918 (ITGB3) were the most studied. As for relevance, of the 64 genetic variants evaluated by the articles, 14 had statistical significance (p< 0.05; 95% confidence interval [CI]) in at least one article. Among them, the following have had unanimous results: rs1371097 (P2RY1), rs1045642 (MDR1), rs1051931 and rs7756935 (PLA2G7), rs2071746 (HO1), rs1131882 and rs4523 (TBXA2R), rs434473 (ALOX12), rs9315042 (ALOX5AP), and rs662 (PON1), while these differ in real interference in AR: rs5918 (ITGB3), rs2243093 (GP1BA), rs1330344 (PTGS1), and rs20417 (PTGS2). As study limitations, we highlight the nonuniform methodologies of the analyzed articles and population differences. Conclusion It is noteworthy that pharmacogenetics is an expanding area. Therefore, further studies are needed to better understand the association between genetic variants and AR.


Resumo Antecedentes A farmacogenética promete melhorar o controle de doenças como as cardiovasculares. O ácido acetilsalicílico, a aspirina, previne a formação de um agente ativador da agregação plaquetária e vasoconstrição e é usado na prevenção de tais doenças. No entanto, os pacientes podem ter falha no tratamento devido a variantes genéticas que modificam o metabolismo da droga causando resistência à aspirina (RA). Objetivos Realizar uma revisão sistemática da literatura para determinar o impacto das variantes genéticas na resistência à aspirina. Métodos Artigos publicados nos bancos de dados MEDLINE/PubMed, Cochrane, Scopus, LILACS e SCIELO foram sistematicamente selecionados. Foram identificados 290 artigos e, destes, 269 artigos foram excluídos por não atenderem aos critérios de inclusão previamente estabelecidos. Um total de 20 estudos caso-controles e 1 coorte foi incluído. Resultados As variantes genéticas rs1126643 (ITGA2), rs3842787 (PTGS1), rs20417 (PTGS2) e rs5918 (ITGB3) foram as mais estudadas. Quanto à relevância, das 64 variantes genéticas avaliadas pelos artigos, 14 tiveram significância estatística (p< 0,05; intervalo de confiança [IC] de 95%) em pelo menos um artigo. Entre eles, os seguintes tiveram resultados unânimes: rs1371097 (P2RY1), rs1045642 (MDR1), rs1051931 e rs7756935 (PLA2G7), rs2071746 (HO1), rs1131882 e rs4523 (TBXA2R), rs434473 (ALOX12), rs9315042 (ALOX5AP) e rs662 (PON1), enquanto estes diferiram na interferência real na RA: rs5918 (ITGB3), rs2243093 (GP1BA), rs1330344 (PTGS1) e rs20417 (PTGS2). Como limitações do estudo, destacam-se as metodologias não uniformes dos artigos analisados e as diferenças populacionais. Conclusão Vale ressaltar que a farmacogenética é uma área em expansão. Portanto, mais estudos são necessários para entender melhor a associação entre variantes genéticas e RA.

2.
BrJP ; 6(supl.2): 85-89, 2023.
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1513798

ABSTRACT

ABSTRACT BACKGROUND AND OBJECTIVES: Cannabis is the most popular and consumed illicit drug in the world, it has about 540 bioactive phytocannabinoids, including tetrahydrocarbinol (THC) and cannabidiol (CBD). The therapeutic potential of phytocannabinoids has been the subject of many studies in recent decades for many medical situations, including the management of chronic pain. The advent of pharmacogenetics currently allows the indication of the Cannabis dose to be evaluated individually. The objective of this work was to carry out a survey of the literature on the medicinal use of Cannabis and the application of pharmacogenetics in this therapy. CONTENTS: THC and CBD phytocannabinoids are the most abundant and researched. In the endocannabinoid system there are compounds similar to phytocannabinoids, cell receptors and metabolism enzymes. All these molecules are secreted from genes, which may have individual genetic polymorphisms that determine the modulation of the endocannabinoid system, and consequently impact the patients' therapeutic response. CONCLUSION: The existence of genetic tests for the prior assessment of the patients genetic profile in order to avoid side effects and to have more assertiveness in the indication of the cannabis product is an important tool to increase adherence to cannabis treatment.


RESUMO JUSTIFICATIVA E OBJETIVOS: A cannabis é a droga ilícita mais popular e consumida no mundo, possuindo cerca de 540 fitocanabinoides bioativos, entre eles o tetra-hidrocarbinol (THC) e o canabidiol (CBD). O potencial terapêutico dos fitocanabinoides tem sido alvo de muitos estudos nas últimas décadas para muitas situações médicas, incluindo o manejo da dor crônica. O advento da farmacogenética permite que atualmente a indicação da dose de cannabis seja avaliada individualmente. O objetivo deste estudo foi realizar um levantamento da literatura sobre o uso medicinal da cannabis e a aplicação da farmacogenética nessa terapia. CONTEÚDO: Os fitocanabinoides THC e CBD são os mais abundantes e pesquisados. No sistema endocanabinoide, existem compostos similares aos fitocanabinoides, receptores celulares e enzimas de metabolismo. Todas essas moléculas são secretadas a partir de genes que podem possuir polimorfismos genéticos individuais determinantes para a modulação do sistema endocanabinoide e, consequentemente, impactam a resposta terapêutica do paciente. CONCLUSÃO: A existência de testes genéticos para avaliação prévia do perfil genético do paciente a fim de evitar efeitos colaterais e ter mais assertividade na indicação do produto de cannabis é uma importante ferramenta para aumentar a aderência ao tratamento com cannabis.

3.
Saude e pesqui. (Impr.) ; 15(4): e10740, out.-dez. 2022.
Article in Portuguese | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1411745

ABSTRACT

Caracterizar o perfil epidemiológico, clínico e genético de pacientes com Covid-19. Realizou-se um estudo observacional e transversal com voluntários que tiveram diagnóstico de Covid-19 no período de abril de 2020 a maio de 2021 no município de Santa Cruz do Sul (RS, Brasil), no qual foram coletados dados clínicos e epidemiológicos, além de amostras de sangue para a identificação de polimorfismos no gene ACE2. Foram recrutados 87 indivíduos e destes, 16,7% necessitaram de internação hospitalar, sendo a maioria do sexo masculino. A obesidade foi a comorbidade mais frequente, no entanto, doenças cardiovasculares, hipertensão e diabetes apresentaram maior significância quando associadas às internações. Em relação à características genéticas, entre os voluntários não foram encontrados polimorfismos no gene ACE2. A pesquisa sugere que o sexo masculino e presença de comorbidades são importantes fatores de risco para a severidade da Covid-19.


Current paper characterizes the epidemiological, clinical and genetic profile of patients with Covid-19. An observational and cross-sectional study was carried out with volunteers diagnosed with Covid-19 between April 2021 and May 2021 in the municipality of Santa Cruz do Sul, Brazil; a blood sample also identified polymorphism in the ACE2 gene. 87 patients were recruited; 6.7% required hospitalization, the majority being male. Although obesity was a more frequent co-morbidity, cardiovascular diseases, hypertension and diabetes were more significant when associated with hospitalizations. In the case of genetic characteristics, polymorphisms were found in the ACE2 gene among volunteers. Important research suggests male gender and co-morbidities are risk factors for the severity of Covid-19.

4.
J. Phys. Educ. (Maringá) ; 33: e3351, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1421868

ABSTRACT

ABSTRACT Objective: To analyze potential influences of the R/X genetic polymorphism of the ACTN3 gene, as well as of anthropometric and metabolic characteristics on the functional performance of elderly women assisted in primary health care. Method: One hundred and forty-one elderly women were assessed in terms of anthropometric, metabolic and functional aspects, in addition to clinical, cognitive and demographic characteristics. Allele and genotype frequencies of ACTN3 gene polymorphism were determined. Results: 141 elderly women (68.30 ± 6.18 years) were evaluated. No significant differences (p > 0.05) were observed between the RR and RX/XX genotypes in the elderly women's functional performance, anthropometric or metabolic characteristics. The TUG test completion time showed positive correlations with age, body mass index, waist circumference, and fat percentage (s = 0.315; p < 0.001; s = 0.238; p = 0.005; s = 0.174; p = 0.039; s = 0.207; p = 0.014), respectively. Negative correlations were found between the TUG test with absolute handgrip strength (s = - 0.314; p < 0.001) and relative handgrip strength (s = - 0.380; p < 0.001). Conclusion: In our study, there were no influences from ACTN3 gene polymorphisms on the functional performance of the elderly women, which is influenced by other factors.


RESUMO Objetivo: analisar as potenciais influências do polimorfismo genético R/X do gene ACTN3 e das características antropométricas e metabólicas no desempenho funcional de mulheres idosas atendidas na atenção primária em saúde. Método: Cento e quarenta e uma idosas foram avaliadas em relação as características antropométricas, metabólicas, funcionais, aspectos clínicos, cognitivos e demográficos. Foram determinadas as frequências de alelos e genótipos do polimorfismo do gene ACTN3. Resultados: 141 idosas (68,30 ± 6,18 anos) foram avaliadas. Não foram observadas diferenças significativas (p > 0,05) entre os genótipos RR e RX/XX no desempenho funcional, características antropométricas ou metabólicas das idosas. O tempo de realização do TUG apresentou correlações positivas com idade, índice de massa corporal, circunferência da cintura e percentual de gordura (s = 0,315; p < 0,001; s = 0,238; p = 0,005; s = 0,174; p = 0,039; s = 0,207; p = 0,014) respectivamente. Correlações negativas foram observadas entre o TUG com força de preensão manual absoluta (s = - 0,314; p < 0,001) e relativa (s = - 0,380; p < 0,001). Conclusão: Em nosso estudo, não foram observadas influências dos polimorfismos do gene ACTN3 no desempenho funcional das idosas, sendo este, influenciado por outros fatores.


Subject(s)
Humans , Female , Middle Aged , Aged , Polymorphism, Genetic/genetics , Primary Health Care , Genetic Variation/genetics , Women , Aged/physiology , Aging/physiology , Body Mass Index , Anthropometry/instrumentation , Muscle Strength/physiology , Physical Functional Performance , Metabolism
5.
Pesqui. vet. bras ; 39(11): 915-922, Nov. 2019. tab, ilus
Article in English | VETINDEX, LILACS | ID: biblio-1056912

ABSTRACT

Malassezia pachydermatis is a lipophilic and lipid-dependent yeast mostly isolated from animals' skin; hence, it is regarded as a zoophilic species causing otitis externa in dogs. Aspects associated with its epidemiology and pathogenicity is a matter of interest. This study aimed to conduct a molecular characterization of 43 isolates of M. pachydermatis obtained from dogs with otitis externa. For this purpose, the 5.8S internal transcribed spacer 2 (ITS2) and D1/D2 26S rRNA regions were amplified, sequenced and analyzed using restriction fragment length polymorphism (RFLP) with AluI, CfoI, and BstF5I endonucleases. Phylogenetic analyses revealed that these isolates grouped with the sequence types I, IV and V, previously proposed for M. pachydermatis. Interestingly, we found a new polymorphic RFLP pattern using BstF5I, these isolates were associated with the sequence types IV and V, nevertheless an association between polymorphic RFLP patterns, and fosfolipase activity or canine population data was not observed. These findings underline the genetic diversity of M. pachydermatis and provide new insights about the epidemiology of this species in the analyzed population.(AU)


Malassezia pachydermatis é uma levedura lipofílica e dependente de lipídios, principalmente da pele de animais. Sendo, por essa razão, considerada uma espécie zoofílica e causadora de otite externa em cães. Neste sentido, aspectos associados à sua epidemiologia e patogenicidade constituem um tema de interesse científico. O objetivo deste estudo foi realizar a caracterização molecular de 43 isolados de M. pachydermatis obtidos a partir de cães com otite externa. Para esta propósito, foram amplificadas, sequenciadas e analisadas com enzimas de restrição as regiões do gene 5.8S, do espaçador interno transcrito 2 (ITS2) e D1/D2 do 26S do rRNA pelo método RFLP, com as endonucleases AluI, CfOI e BstF5I. Análises filogenéticas revelaram que os isolados se agruparam com as sequências tipo I, IV e V de M. pachydermatis como já descrito anteriormente. De maneira interessante, se observou um novo RFLP polimórfico utilizando BstF5I. Os isolados que mostraram esse padrão foram associados com os padrões IV e V. No entanto, não foi observada associação entre padrões polimórficos de RFLP e atividade de fosfolipase ou dados da população canina. Estes resultados demonstram a diversidade genética de M. pachydermatis e fornecem novas perspectivas sobre a epidemiologia destas espécies na população analisada.(AU)


Subject(s)
Animals , Dogs , Genetic Variation , Malassezia/isolation & purification , Malassezia/genetics , Otitis Externa/veterinary , Polymorphism, Restriction Fragment Length , Polymerase Chain Reaction/veterinary , Colombia/epidemiology , Dog Diseases/microbiology
6.
Rev. Assoc. Med. Bras. (1992) ; 65(6): 786-790, June 2019. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1012975

ABSTRACT

SUMMARY OBJECTIVE: This study was to assess the genetic association of copy number variations in two genes (PRKAB2 and PPM1K) located in two regions (tetralogy of Fallot and ventricular septal defect) in a Chinese Han population. METHODS: A total of 200 congenital heart disease patients (100 tetralogy of Fallot patients and 100 ventricular septal defect patients) and 100 congenital heart defect-free controls were recruited, and quantitative real-time PCR analysis was used to replicate the association of two copy number variations with congenital heart defects in a Chinese Han population. RESULTS: One deletion at PRKAB2 and one duplication at PPM1K were found in two of the tetralogy of Fallot patients, respectively; while all these regions were duplicated in both ventricular septal defect patients and in the 100 congenital heart defects-free controls. CONCLUSIONS: We replicated the copy number variations at the disease-candidate genes of PRKAB2 and PPM1K with tetralogy of Fallot in a Chinese Han population, and in patients with ventricular septal defect mutations in these two genes were not found. These results indicate the same molecular population genetics exist in these two genes with different ethnicity. This shows that these two genes are possibly specific pf tetralogy of Fallot candidates.


RESUMO OBJETIVO: Este estudo teve como objetivo avaliar a associação genética do número de cópias em dois genes (PRKAB2 e PPM1K) localizados em duas regiões (tetralogia de Fallot e comunicação interventricular) em uma população chinesa da etnia Han. METODOLOGIA: Um total de 200 pacientes com doença cardíaca congênita (100 pacientes com tetralogia de Fallot e 100 com comunicação interventricular) e 100 indivíduos livres de defeitos cardíacos congênitos foram recrutados, e uma análise quantitativa de PCR em tempo real foi utilizada para replicar a associação de duas variações de número de cópia de defeitos cardíacos congênitos, em uma população chinesa da etnia Han. RESULTADOS: Uma supressão em PRKAB2 e duplicação em PPM1K foram encontradas em dois pacientes com tetralogia de Fallot, respectivamente; todas essas regiões estavam duplicadas nos pacientes com comunicação interventricular e nos 100 indivíduos livres de defeitos cardíacos congênitos. CONCLUSÃO: Nós replicado a variações no número de cópias de genes candidatos de doença PRKAB2 e PPM1K com tetralogia de Fallot em uma população chinesa da etnia Han; em pacientes com comunicação interventricular, não foram encontradas mutações nesses dois genes. Estes resultados indicam que a mesma genética de população molecular existe nestes dois genes em diferentes etnias. Isso mostra que esses dois genes são possivelmente candidatos a genes específicos de tetralogia de Fallot.


Subject(s)
Humans , Tetralogy of Fallot/genetics , Protein Tyrosine Phosphatase, Non-Receptor Type 11/genetics , AMP-Activated Protein Kinases/genetics , DNA Copy Number Variations , Heart Septal Defects, Ventricular/genetics , Reference Values , Case-Control Studies , Genetic Association Studies , Real-Time Polymerase Chain Reaction
7.
Rev. colomb. cienc. pecu ; 32(2): 107-116, abr.-jun. 2019. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1013921

ABSTRACT

Abstract Background: Genetic information is necessary to devise strategic plans aimed to improve the genetic merit of buffalos. Objective: To assess the effect of genetic polymorphisms in GH, Pit-1, GHR, GHRHR, and KCN3 genes on milk production and body weight of Khuzestan water buffaloes. Methods: Blood samples were collected from 60 buffaloes from the Khuzestan province, Iran. Using the PCR-RFLP technique, the amplified and digested fragments of GH/AluI, GHR/AluI, GHRHR/ HaeIII, Pit1/HinfI, and KCN3/HindIII were genotyped. Results: All animals were monomorphic for GHRHR. The frequency of mutant alleles for GH, GHR, KCN3, and Pit1 was 47.5, 74.2, 49.2, and 51.7%, respectively. There were significant differences (p<0.0001) in the genotypic frequencies of GH, GHR, and Pit1 between high and low milk-yielding buffaloes. The GH (p=0.0002), GHR (p<0.0001) and Pit1 (p<0.0001) polymorphisms also had significant effects on body weight. Sequencing results revealed the presence of C496A, G495A, G498A and C1501T SNPs in the GH, and G1702T in the GHR gene of Khuzestan buffalos. Conclusion: This study highlights the importance of GH, GHR, and Pit1 on milk production and body weight of Khuzestan buffaloes. The results suggest that devising an integrated breeding plan in Khuzestan water buffalos can considerably benefit from the very high diversity in candidate genes.


Resumen Antecedentes: La información genética es necesaria para diseñar planes estratégicos con el objeto de mejorar el mérito genético de los búfalos. Objetivo: Evaluar el efecto de los polimorfismos genéticos en los genes GH, Pit-1, GHR, GHRHR y KCN3 sobre la producción láctea y peso corporal de búfalos de agua de la provincia de Juzestán, Iran. Métodos: Se recolectaron 60 muestras de sangre de búfalos de la provincia de Juzestán, en Irán. Los fragmentos amplificados y digeridos de GH/AluI, GHR/AluI, GHRHR/HaeIII, Pit1/HinfI y KCN3/HindIII fueron clasificados genotípicamente, utilizando la técnica PCR-RFLP. Resultados: Todos los animales fueron monomórficos para el gen GHRHR. La frecuencia alélica de alelos mutantes para los genes GH, GHR, KCN3 y Pit1 fue 47,5, 74,2, 49,2 y 51,7%, respectivamente. Se encontraron diferencias significativas (p<0,0001) en las frecuencias genotípicas de GH, GHR y Pit1 entre búfalos de alta y baja producción. El efecto del polimorfismo GH (p=0,0002), GHR (p<0,0001) y Pit1 (p<0,0001) también fue significativo para peso corporal. Los resultados de la secuenciación revelaron la presencia de SNPs C496A, G495A, G498A y C1501T en GH, y G1702T en el gen GHR. Conclusiones: Este estudio resalta la importancia de los genes GH, GHR y Pit1 sobre la producción de leche y el peso corporal de búfalos de Juzestán. Los resultados sugieren que la elaboración de un plan de cruzamiento integrado en búfalos de agua de Juzestán puede beneficiarse considerablemente de la gran diversidad de genes candidatos.


Resumo Antecedentes: Determinação informações genéticas é o passo crítico para elaborar planos estratégicos com o objetivo de melhorar o mérito genético dos búfalos. Objetivo: Avaliar o efeito de polimorfismos genéticos nos genes GH, Pit-1, GHR, GHRHR e KCN3 na produção de leite e no peso corporal dos búfalos de água do Cuzistão, Irã. Métodos: Amostras de sangue foram coletadas de 60 búfalos da província de Cuzistão, no Irã. Utilizando a técnica PCR-RFLP, os fragmentos amplificados e digeridos de GH/AluI, GHR/AluI, GHRHR/HaeIII, Pit1/HinfI e KCN3/ HindIII foram genotipados. Resultados: Todos os animais eram monomórficos para o gene GHRHR. A freqüência alélica de alelos mutantes para os genes GH, GHR, KCN3 e Pit1 foi 47,5, 74,2, 49,2 e 51,7%, respectivamente. Uma diferença significativa (p<0,0001) foi encontrada nas freqüências genotípicas de os genes GH, GHR e Pit1 entre búfalos de alta e baixa produção. O efeito do polimorfismo GH (p=0,0002), GHR (p<0,0001) e Pit1 (p<0,0001) também foi significativo para o peso corporal. Os resultados da sequenciação revelaram a presença de SNPs C496A, G495A, G498A e C1501T no GH, e G1702T no gene GHR dos buffalos do Cuzistão. Conclusões: Este estudo destacou a importância da GH, GHR e Pit1 na produção de leite e no peso corporal de buffalos do Cuzistão. Os resultados sugerem que a elaboração de um plano de melhoramiento genético integrado em búfalos de água do Cuzistão pode beneficiar consideravelmente da grande diversidade de genes candidatos.

8.
Biosci. j. (Online) ; 34(4): 943-951, july/aug. 2018. tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-967160

ABSTRACT

In Brazil, the improvement of papaya agribusiness is correlated to the estimation of genetic parameters and evaluation of agronomic descriptors; thus enabling less favourable areas for the development and implementation of papaya crops. Therefore, the current study aimed to evaluate quantitative descriptors and to estimate genetic parameters in genotypes of papaya grown under subtropical climate in the state of São Paulo. The experimental design was randomized in block. The experimental units were grouped into seven blocks of five plants each and three treatments, which consisted of three different varieties: Sunrise Solo, Tainung nº1 and local. The psychochemical properties were analysed for plant height; intersection height of first fruits; stem diameter; male, female and hermaphroditic flower percentage; fruit number per plant; production; yield; normal fruits percentage, carpeloid and pentandric fruits; pulp matter; pulp length; pulp diameter; pulp shape; pulp cavity; pulp thickness; peel performance; pulp performance; seeds performance; seeds number; soluble solids; pH; titratable acidity; ratio; technological index; ascorbic acid and reducing sugars. Furthermore, most agronomic descriptors showed high heritability; besides that, the varieties Sunrise Solo and Tainung nº1 performed the best results in Botucatu.


A estimativa de parâmetros genéticos e a avaliação de descritores agronômicos do mamoeiro pode contribuir com o desenvolvimento do agronegócio do mamão no Brasil, permitindo a expansão de novos cultivos em regiões menos favoráveis para sua exploração comercial. Frente ao exposto, objetivou-se com este trabalho avaliar descritores quantitativos e estimar parâmetros genéticos em genótipos de mamoeiro, cultivados em clima subtropical do estado de São Paulo. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, com três tratamentos (variedade Sunrise Solo, híbrido Tainung nº1 e variedade local) e sete blocos, utilizando cinco plantas por parcela experimental. Foram mensuradas as seguintes caraterísticas: altura das plantas e da interseção dos primeiros frutos; diâmetro do caule; porcentagens de plantas masculinas, femininas e hermafroditas; número de frutos por planta; produção; produtividade; porcentagem de frutos normais, carpelóides e pentândricos; massa, comprimento, diâmetro, formato, diâmetro da cavidade interna e espessura da polpa dos frutos; rendimento de casca, de polpa e de sementes; número de sementes; sólidos solúveis; pH; acidez titulável; ratio; índice tecnológico; ácido ascórbico e açúcares redutores. Foi possível inferir com o estudo que há alta herdabilidade quanto à maioria dos descritores agronômicos avaliados e que os bons resultados para a variedade Sunrise Solo e o híbrido Tainung nº 1, possibilitam a indicação desses genótipos para cultivo, na região de Botucatu ­ SP.


Subject(s)
Genetic Variation , Carica , Plant Breeding , Crop Production , Agribusiness
9.
Rev. odontol. Univ. Cid. São Paulo (Online) ; 30(2): 216-222, abr.-jun. 2018. ilus.
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-966344

ABSTRACT

A amelogênese imperfeita é uma alteração genética que acomete a morfologia do esmalte dentário, podendo ocorrer na dentição decídua e/ou permanente. Por apresentar um amplo espectro clínico é de suma importância um diagnóstico precoce para um correto planejamento odontológico. Diante disso, objetivou-se apresentar o caso de uma criança portadora de amelogênese imperfeita, incluindo o diagnóstico e os tratamentos executados, por um período de 4 anos. Paciente AHM, sexo feminino, 7 anos, procurou o Centro de Saúde Veiga de Almeida para acompanhamento odontológico de rotina. Apresentava dentição mista hígida e alterações de cor na coroa dentária nos incisivos e molares permanentes. Nesse momento foi diagnosticada como portadora de hipomineralização de molares e incisivos. Após a erupção dos demais dentes permanentes e o acometimento de praticamente todos os elementos, a criança foi diagnosticada como portadora de amelogênese imperfeita. Durante o período de tratamento foram realizados diversos procedimentos, entre eles restaurações, microabrasão, facetas em resina composta e coroa do tipo onlay. Pode-se concluir que o cirurgião-dentista deve estar atento quanto aos sinais e sintomas dos pacientes portadores de amelogênese imperfeita, juntamente com possíveis alterações emocionais que acometem esses pacientes. O tratamento executado foi considerado um sucesso, uma vez que as queixas da paciente foram atendidas através de um tratamento odontológico adequado capaz de restabelecer a função e a estética da criança.


Amelogenesis imperfecta is a genetic alteration that affects the dental enamel morphology, and may occur in the deciduous and/or permanent dentition, with or without systemic involvement. For presenting a broad clinical spectrum of paramount importance is a prior diagnosis for a correct dental planning. The objective was to present the report of a child with amelogenesis imperfecta, including diagnosis and treatments performed, for a period of 4 years. Patient AHM, female, 7 years, sought the Veiga de Almeida Health Center for routine dental follow-up. She presented mixed dentition with color enamel alteration in the dental crown on the permanent and molar incisors. At this moment she was diagnosed as having molar-incisive hypomineralization. After the eruption of the remaining teeth and the involvement of almost al the elements, the child was diagnosed as having amelogenesis imperfecta. During the treatment period, restorations, microabrasion, composite resin facets and onlay type crown were performed. It can be concluded that the dental surgeon should be aware of the signs and symptoms of patients with imperfect amelogenesis. The treatment performed was considered a success at a time and the patient complaints were answered, receiving adequate dental treatment and restoration of the child's function and aesthetics.


Subject(s)
Humans , Female , Child , Genetic Variation , Amelogenesis Imperfecta , Dental Enamel
10.
São Paulo; s.n; s.n; 2018. 83 p. tab, ilus, graf.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-909508

ABSTRACT

Os genes de receptores olfatórios (OR) pertencem a uma família de proteínas de membrana formada por cerca de 1000 genes no genoma de camundongo. Os genes OR são expressos de forma monogênica e monoalélica nos neurônios olfatórios (OSNs). No entanto, ainda não está claro o mecanismo que permite essa forma de expressão peculiar, sobretudo, qual o papel da metilação de DNA nesse processo. Nosso estudo determinou o padrão de metilação de DNA da região promotora e codificadora do gene Olfr17. Em células de epitélio olfatório (MOE) de camundongos adultos, observamos na região codificadora (CDS) do gene uma frequência de metilação em dinucleotídeos CpG 58%, enquanto que na sua região promotora ela foi bem mais baixa. Os níveis de metilação do Olfr17 em MOE de embrião (E15.5) e fígado foram similares aos observados em MOE de animais adultos. Em seguida, analisamos se a metilação de DNA pode regular a expressão gênica do Olfr17. Utilizando animais transgênicos onde os neurônios olfatórios que expressam Olfr17 também expressam GFP, pudemos selecionar neurônios olfatórios GFP+ e analisar a metilação do gene Olfr17, que está ativo nestas células. Verificamos que o padrão geral de metilação do Olfr17, tanto na região CDS como na região promotora, não se altera quando este gene está ativo. Este resultado indica que alterações na metilação do gene Olfr17 não são necessárias para que este receptor seja expresso. Finalmente, verificamos que a região promotora do gene Olfr17, de duas linhagens de camundongos diferentes, a C57BL/6 e a 129, possuem dois polimorfismos de base única (SNPs) que alteram o conteúdo CpG. Devido a estes SNPs, a linhagem 129 apresenta dois sítios CpG adicionais, inexistentes na linhagem C57BL/6. Nossas análises mostraram que estes CpGs são frequentemente metilados, o que torna o promotor do Olfr17 de 129 significativamente mais metilado que o promotor de C57BL/6. Em seguida, nós analisamos o nível de expressão no MOE dos dois alelos de Olfr17, o 129 e o C57BL/6, utilizando ensaios de RT-qPCR. Estes experimentos demonstraram que o nível de expressão do alelo 129, que possui 3 CpGs metiladas em seu promotor, é menor que o do alelo C57BL/6, que apresenta apenas uma CpG que é pouco metilada em seu promotor. Nossos resultados sugerem que as alterações na região promotora influenciam a probabilidade com que o gene OR é escolhido para ser expresso no MOE


Olfactory receptor (OR) genes belong to a large family of membrane proteins composed of 1000 genes in the mouse genome. The OR genes are expressed in the olfactory sensory neurons (OSNs) in a monogenic and monoallelic fashion. However, the mechanisms that govern OR gene expression are unclear. Here we asked whether DNA methylation plays a role in the regulation of OR gene expression. We first determined the DNA methylation pattern in the coding (CDS) and promoter regions of the odorant receptor gene Olfr17. In olfactory epithelium (MOE) cells, the CpG methylation level in the CDS is 58% but is much lower in the promoter region of the gene. In embryonic MOE (E15.5) and liver, the levels of Olfr17 DNA methylation are similar to the ones shown in adult MOE. We next analyzed whether DNA methylation is involved in Olfr17 regulation. We isolated GFP+ neurons from transgenic mice that coexpress GFP with Olfr17, and analyzed the DNA methylation pattern of the Olfr17, which is active in these cells. We found that the general methylation pattern, both, in the coding and promoter regions is not altered in the active gene. These results indicate that changes in DNA methylation are not required for the activation of Olfr17. Finally, we found that the Olfr17 promoter region from two different mouse strains, C57BL/6 and 129, has two single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that alter the CpG content. The SNPs lead to the existence of two additional CpGs in the 129 allele, which are absent in the C57BL/6 allele. These CpGs are frequently methylated, making the 129 Olfr17 promoter significantly more methylated than the Olfr17 promoter from C57BL/6. We next performed RT-qPCR experiments to analyze the expression levels of the 129 and C57BL/6 Olfr17 alleles in the MOE. These experiments showed that the expression level of the 129 Olfr17 allele, which contains three methylated CpGs in its promoter region, is lower than the one from C57BL/6, which contains only one, undermethylated CpG, in its promoter. Our results suggest that these promoter modifications regulate the probability of the OR gene choice


Subject(s)
Animals , Male , Female , Mice , Receptors, Odorant/analysis , DNA Methylation/physiology , Polymorphism, Single Nucleotide , Genetic Variation , Gene Expression
11.
Acta sci., Biol. sci ; 39(1): 45-52, jan.-mar. 2017. tab, ilus
Article in English | LILACS | ID: biblio-846597

ABSTRACT

Growers appreciate Cattleya walkeriana and C. loddigesii due to striking shape and rarity. Thus, this study aimed to evaluate the feasibility of DNA barcode regions, namely ITS1, ITS2 and rpoC1, to discriminate between C. walkeriana and C. loddigesii species. DNA barcode regions were successfully amplified using primers designed to amplify plants. We also included sequences from public databases in order to test if these regions were able to discriminate C. walkeriana and C. loddigesii from other Cattleya species. These regions, and their combinations, demonstrated that the ITS1+ITS2 had the highest average interspecific distance (11.1%), followed by rpoC1 (1.06%). For species discrimination, ITS1+ITS2 provided the best results. The combined data set of ITS1+ITS2+rpoC1 also discriminated both species, but did not result in higher rates of discrimination. These results indicate that ITS region is the best option for molecular identification of these two species and from some other species of this genus.


As espécies Cattleya walkeriana e C. loddigesii são apreciadas pelos colecionadores devido às suas impressionantes forma e raridade. Este estudo teve como objetivo avaliar a viabilidade das regiões DNA barcode, ou seja, ITS1, ITS2 e rpoC1, para discriminar as espécies C. walkeriana e C. loddigesii. Regiões DNA barcode foram amplificadas com êxito utilizando os iniciadores desenhados para plantas. Nós também incluímos sequências de bases públicas de dados, a fim de testar se estas regiões foram capazes de discriminar C. walkeriana e C. loddigesii de outras espécies de Cattleya. Estas regiões e suas combinações demonstraram que o ITS1 + ITS2 teve a maior distância média interespecífica (11,1%), seguido por rpoC1 (1,06%). Para a discriminação das espécies, ITS1 + ITS2 proporcionaram os melhores resultados. Os dados combinados dos ITS1 + ITS2 + rpoC1 também discriminaram ambas as espécies, mas não resultaram em maiores taxas de discriminação. Estes resultados indicam que a região ITS é a melhor opção para a identificação molecular destas duas espécies e a partir de algumas outras espécies deste gênero.


Subject(s)
Orchidaceae/genetics
12.
Fortaleza; s.n; 2016. 105 p. ilus, tab.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-971945

ABSTRACT

A terapia antirretroviraltemporobjetivodiminuiramorbidadeemortalidadedaspessoascomHIV/AIDS,melhorandoaqualidadeeaexpectativadevida. Paradoxalmente, o tratamento irregular pode favorecer a seleçãode variantes resistentes, representandouma das principais causas de falha terapêutica. Tais cepas resistentes podem ser transmitidas a outros indivíduos(resistência transmitida), predispondo àfalha precoce do tratamento inaugural. Ostestesderesistência,principalmenteagenotipagem,permitemadetecçãodemutaçõesdogenomaviral.OobjetivodesteestudofoicaracterizarasmutaçõesderesistênciatransmitidadoHIV-1aosantirretroviraisempacientesrecém-diagnosticadosnoCentro de Testagem e Aconselhamento (CTA) de Fortaleza.Duranteoperíododeoutubrode2013asetembrode2014,foramrecrutadospacientescomtestereagente para oHIVrealizadono CTA. Foram colhidas amostras para realizaçãode quantificação da cargaviral(AbbottRealTime),contagemdelinfócitos CD4+(FACSCaliburBD)egenotipagemHIV-1(TruGeneSiemens).As sequências genéticasforam alinhadas pelo programa MEGA eBioEdit. Ossubtipos do vírus HIV-1 foram determinados e identificados empregando análises no banco de dados do REGA HIV Subtyping Tool. A análisedas mutações de resistência aos antirretrovirais foi realizada utilizando o algoritmo da Universidade de Stanford(HIVdbProgram)e as mutaçõesderesistênciatransmitidaforamidentificadasempregandoaCalibraçãodeResistênciaPopulacional.Foram obtidas amostras biológicas de 108 pacientes, sendo que em 105delas foi possível realizar a reação de sequenciamentoea avaliação quantoàpresençademutaçõesderesistênciaassociadasaos antirretrovirais...


Antiretroviral therapy aims to reduce morbidity and mortality of people with HIV / AIDS, improving the quality and life expectancy. Paradoxically, the irregular treatment may favor the selection of resistant variants, representing a major cause of treatment failure. Such resistant strains can be transmitted to other individuals (transmitted resistance) predisposing to early failure of the inaugural treatment. Resistance tests, particularly genotyping, allow mutation detection in the viral genome. Theaim of this study was to characterize the transmitted resistance HIV-1 mutations to antiretroviral drugs in newly diagnosed patients in the Counseling and Testing Center (CTC) in Fortaleza. During the period October 2013 to September 2014, patients with reagent test for HIV were recruited at CTC. Samples for viral load quantitation (Abbott RealTime), CD4 lymphocytes count (BD FACSCalibur) and HIV-1 genotyping (TRUGENE Siemens), were collected. Genetic sequences were aligned by MEGA and BioEdit program. Thesubtypes of HIV-1 were determined and identified using analysis in REGA HIV subtyping Tool database. The analysis of the antiretroviral resistance mutation was performed using the algorithm of Stanford University (HIVdb Program) and transmitted mutation resistance was identified using the CalibratedPopulationResistance (CPR). Biological samples were obtained from 108 patients, among which in 105 was possible to perform the sequencing reaction and evaluation for the presence of mutations to conferantiretroviral drugresistance...


Subject(s)
Humans , Antiretroviral Therapy, Highly Active , Drug Resistance, Viral , Mutation , Genetic Variation
13.
Rev. colomb. cienc. pecu ; 28(3): 272-278, jul.-sep. 2015. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-757275

ABSTRACT

Background: according to several authors, domestic pigs come from different wild boar populations with varied geographic distribution and are grouped in the genus Sus. Pig domestication occurred gradually. The first animals were small and gathered in small numbers. Several civilizations domesticated this animal as an important source of protein. Tierralta, in Córdoba province, has a large population of domestic pigs, which are a mixture of creole and other breeds. The genetic characterization of populations is used to check the status of genetic diversity, a conclusive element in determining breeding strategies and genetic conservation programs. PCR is the most commonly used technique for studying highly polymorphic markers, such as microsatellites or SSRs. The use of microsatellites is a powerful tool in genetic studies. They have been used for characterization studies of genetic diversity, genetic relationships between populations, paternity testing, inbreeding and genetic bottlenecks. Objective: the purpose of this study was to determine the genetic diversity of domestic pigs in Tierralta (Córdoba, Colombia) using 20 microsatellites. Methods: fifty four samples were studied. Twenty microsatellites recommended by the FAO/ISAG for swine biodiversity studies were used. Results: all the microsatellites were polymorphic, and were detected between 3 (SW911) and 14 (TNFB) alleles (the average number was 6.9 alleles) and a total of 138 alleles were detected. Average expected heterozygosity was 0.5259 and the observed heterozygosity was 0.5120. PIC values ranged from 0.3212 to 0.7980 for loci SW2410 and IFNG, respectively. Conclusions: the results suggest that the analyzed population represents a group with high genetic diversity.


Antecedentes: varios autores concuerdan en afirmar que los cerdos domésticos provienen de diferentes poblaciones de jabalí salvaje con distinta distribución geográfica y se agrupan en el género Sus. Es aceptado que la domesticación del cerdo, ocurrió de manera lenta y progresiva y que los primeros animales eran pequeños, se reunían en grupos poco numerosos. La preferencia para la domesticación de estos animales en varias civilizaciones, se debió a que ellos representaban una importante fuente proteica. El departamento de Córdoba es una de las regiones de Colombia con mayor población de cerdo doméstico, formada en su mayoría por la mezcla de la raza criolla con otras razas. La caracterización genética de las poblaciones, permite comprobar el estado de la diversidad genética, elemento concluyente en la determinación de estrategias de crianza y de programas genéticos de conservación. La PCR es la técnica más utilizada para el estudio de marcadores extremadamente polimórficos como son los microsatélites o SSRs. Los microsatélites son una poderosa herramienta para estudios genéticos, los cuales han sido utilizados para estudios de caracterización y diversidad genética, relaciones genéticas entre poblaciones, pruebas de paternidad, consanguinidad, cuellos de botella genéticos, entre otros. Objetivo: el objetivo del presente estudio fue determinar la diversidad genética de la población de cerdo doméstico en Tierralta (Córdoba, Córdoba). Método: fueron estudiadas 54 muestras de este grupo. Se usaron 20 microsatélites de los recomendados por la FAO/ISAG para estudios de biodiversidad porcina. Resultados: se determinó que todos los microsatélites utilizados resultaron polimórficos y se detectaron entre 3 (SW911) y 14 (TNFB) alelos, con un número medio de alelos de 6,9 y un total de 138 alelos. La heterocigosidad media esperada fue 0,5259 y la observada 0,5120. Los valores del PIC oscilaron entre 0,3212 y 0,7980 para los loci SW2410 y IFNG, respectivamente. Conclusión: los resultados sugieren que la población de cerdos analizada, representa un grupo con alta diversidad genética.


Antecedentes: vários autores concordam em afirmar que os porcos domésticos vêm de diferentes populações de javalis com distribuição geográfica variada e estão agrupados no gênero Sus. Aceita-se que a domesticação ocorreu lenta e gradualmente e que os primeiros animais eram pequenos e que eles se reuniram em pequenos números. A preferência para a domesticação desses animais em várias civilizações deveu-se ao fato de que eles eram uma importante fonte de proteína. O departamento de Córdoba é uma das regiões com o maior número de porcos domésticos, composto principalmente da raça crioulo misturado com outras raças. A caracterização genética de populações nos permite verificar o estado da diversidade genética, um elemento conclusivo para determinar estratégias de melhoramento e programas de conservação genética. A PCR é uma das técnicas utilizadas no estudo de marcadores polimórficos, como microssatélites ou SSR. Os microssatélites são uma ferramenta poderosa para estudos genéticos, que tem sido usado para estudos de caracterização da diversidade genética, relações genéticas entre populações, testes de paternidade, endogamia e gargalos genéticos, entre outros. Objetivo: o objetivo deste estudo foi determinar a diversidade genética do porco doméstico em Tierralta (Córdoba, Colombia) utilizando-se 20 microssatélites. Método: foram estudados 54 amostras neste grupo. Foram usados 20 microssatélites recomendado pela FAO/ISAG para estudos de biodiversidade suína. Resultados: foram utilizados vinte microssatélites recomendados pela FAO/ISAG para estudos de biodiversidade suína. Determinou-se que todos os microssatélites utilizados foram polimórficos e foram detectados entre 3 (SW911) e 14 (TNFB) alelos, com um número médio de 6,9 alelos e um total de 138 alelos. A heterozigosidade média esperada foi de 0,5259 e o observado foi de 0,5120. Os valores PIC variaram entre 0,3212-0,7980 para loci SW2410 e IFNG, respectivamente. Conclusões: os resultados sugerem que se trata de uma população significativamente diversa.

14.
Arq. bras. cardiol ; 104(1): 24-31, 01/2015. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-741131

ABSTRACT

Background: Congenital heart defects (CHD) are the most prevalent group of structural abnormalities at birth and one of the main causes of infant morbidity and mortality. Studies have shown a contribution of the copy number variation in the genesis of cardiac malformations. Objectives: Investigate gene copy number variation (CNV) in children with conotruncal heart defect. Methods: Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) was performed in 39 patients with conotruncal heart defect. Clinical and laboratory assessments were conducted in all patients. The parents of the probands who presented abnormal findings were also investigated. Results: Gene copy number variation was detected in 7/39 patients: 22q11.2 deletion, 22q11.2 duplication, 15q11.2 duplication, 20p12.2 duplication, 19p deletion, 15q and 8p23.2 duplication with 10p12.31 duplication. The clinical characteristics were consistent with those reported in the literature associated with the encountered microdeletion/microduplication. None of these changes was inherited from the parents. Conclusions: Our results demonstrate that the technique of MLPA is useful in the investigation of microdeletions and microduplications in conotruncal congenital heart defects. Early diagnosis of the copy number variation in patients with congenital heart defect assists in the prevention of morbidity and decreased mortality in these patients. .


Fundamento: Os defeitos cardíacos congênitos são o grupo de anormalidades estruturais mais prevalentes ao nascimento e uma das principais causas de morbidade e mortalidade infantil. Estudos têm mostrado a contribuição da variação no número de cópias na gênese das malformações cardíacas. Objetivos: Investigar a variação no número de cópias gênicas em crianças com defeito cardíaco conotruncal. Métodos: Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) foi realizado em 39 pacientes com defeito cardíaco conotruncal. Avaliação clínica e laboratorial foi realizada em todos os pacientes. Os pais dos probandos que apresentaram alterações também foram investigados. Resultados: Variação no número de cópias foi detectada em 7/39 pacientes: deleção 22q11.2, duplicação 22q11.2, duplicação 15q11.2, duplicação 20p12.2, deleção 19p, duplicação 15q e 8p23.2 com duplicação 10p12.31. As características clínicas foram compatíveis com o relatado na literatura associadas com microdeleção/microduplicação encontrada. Nenhuma dessas alterações foi herdada dos pais. Conclusões: Nossos resultados demonstram que a técnica de MLPA é útil na investigação de microdeleções e microduplicações em defeitos cardíacos congênitos conotruncais. O diagnóstico precoce das variações no número de cópias em pacientes com defeito cardíaco congênito auxilia na prevenção de morbidade e diminuição da mortalidade nesses pacientes. .


Subject(s)
Child , Child, Preschool , Female , Humans , Infant , Infant, Newborn , Male , Chromosome Deletion , Chromosome Duplication/genetics , DNA Copy Number Variations/genetics , Heart Defects, Congenital/genetics , /genetics , Early Diagnosis , Genetic Association Studies , Heart Defects, Congenital/pathology , Heart Defects, Congenital/physiopathology , Heart Septal Defects, Ventricular/genetics , Multiplex Polymerase Chain Reaction , Prospective Studies
15.
São Paulo; s.n; 2014. [95] p. tab, ilus.
Thesis in Portuguese | LILACS, SES-SP | ID: lil-756284

ABSTRACT

Fibrose cística é uma doença genética grave, de herança autossômica recessiva e caracterizada por uma alteração nas secreções das glândulas exócrinas de todo o organismo, resultando principalmente em doença pulmonar obstrutiva crônica progressiva. Pacientes portadores de fibrose cística são frequentemente acometidos por infecções pulmonares causadas por microrganismos específicos. Pseudomonas aeruginosa é o microrganismo mais prevalente, e coloniza cerca de 70% dos pacientes adolescentes e adultos. Os danos ao pulmão aumentam quando P. aeruginosa adquire o fenótipo mucóide. Resistência bacteriana também tem aumentado, sendo relatada a emergência da resistência aos carbapenêmicos. Alguns centros de fibrose cística relatam disseminação de P. aeruginosa entre os pacientes e outros centros relatam grande variabilidade entre os isolados e não identificam transmissão entre os pacientes, o que pode indicar a aquisição ambiental ao invés de uma fonte comum. Este estudo buscou avaliar a sensibilidade aos antimicrobianos frente a P. aeruginosa isoladas do trato respiratório de pacientes com fibrose cística atendidos no Ambulatório do Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) e analisar a variabilidade genética entre os diversos isolados bacterianos de vários pacientes. Um total de 580 isolados de Pseudomonas aeruginosa foram obtidos de 98 pacientes em três períodos de coleta diferentes, destes, 129 isolados de 11 pacientes foram selecionados e analisados. Os isolados foram submetidos ao teste de disco-difusão frente a 14 antimicrobianos. Os isolados que apresentaram resistência ao imipenem foram submetidos à pesquisa fenotípica de metalo-beta-lactamase e pesquisa genotípica para carbapenemases blaSPM, blaIMP, blaVIM e blaNDM, blaKPC e blaGES. O isolado 420-2 com perfil fenotípico suspeito de produção de ESBL foi submetido à pesquisa genotípica dos genes blaCTX-M, blaGES e blaTEM. Os isolados...


Cystic fibrosis (CF) is a serious genetic disease, an autosomal recessive disorder, characterized by an alteration in the secretion of the exocrine gland of all organism, resulting mainly in obstructive cronic progressive lung disease. CF patients are frequently attacked by lung infections caused by specific microorganisms. Pseudomonas aeruginosa is the most prevalent microorganism, and colonizes approximately 70% of adolecents and adults CF patients. The damage to the lung increases when P. aeruginosa acquires mucoid phenotype. Antimicrobial resistance has also been increased and the emergence of resistance to carbapenems has been related. Some CF centers reported the dissemination of P. aeruginosa among CF patients and other centers demonstrated the large variability among the isolates not detecting transmission among the CF patients, which can indicates an environmental acquisition instead of a common source. The aims of this study were to evaluate the susceptibility to antimicrobial agents of P. aeruginosa isolates recovered from respiractory tract of CF outpatients attending the outpatient clinic of Instituto da Criança (University of São Paulo Medical School) and to analyse the genetic variability among P. aruginosa isolates recovered from diverse CF patients. A total of 580 P. aruginosa isolates were recovered from 98 CF patients during three different periods of collection, 129 of these isolates obtained from 11 CF patients were selected and analysed. P. aeruginosa isolates were submitted to the disk-diffusion method testing 14 antimicrobial agents. P. aeruginosa isolates wich presented resistance to imipenem were submitted to the phenotypical test to detect the production of metalo-beta-lactamases, PCR for carbapenemase were carried-out by using specific primers to detect the blaSPM, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaKPC, blaGES genes. The Isolate 420-2 with phenotypic profile suspected of ESBL-producing was submitted to PCR using specific primers...


Subject(s)
Humans , Male , Female , Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field , Cystic Fibrosis , Pseudomonas Infections , Pseudomonas aeruginosa , Drug Resistance, Microbial , Genetic Variation , Outpatients , Microbial Sensitivity Tests
16.
Acta sci., Health sci ; 35(2): 263-271, jul. -dez. 2013. tab, ilus
Article in English | LILACS | ID: biblio-833646

ABSTRACT

Risk estimation tools can be used in clinical practice to promote the counseling, prevention, or increase the surveillance against breast cancer development. The present study aimed to estimate the risk for breast cancer and the odds for BRCA1/2 mutations, and to correlate the values found by the different models. Breast cancer risk was determined by the models of Gail, Claus, BRCAPRO and Boadicea; and for the mutations, Myriad II, Penn II BRCAPRO, and Boadicea models were utilized, in women who have or had the disease (n = 16) and their respective first degree female relatives unaffected (n = 25) . Considering non affected women 16% were categorized as high risk for breast cancer development in five years by the Gail model, and all values presented significant correlation among the models (p < 0.05). Among the participants, 12% (5/41) were considered high risk for BRCA mutations. All the models presented significant correlation between the odds of BRCA1/2 mutation risk, except between Myriad II and Boadicea models. Since there is no model that includes all the variables influencing the development of this disease, it is essential to estimate the risk by more than one model before initiating any clinical intervention.


Ferramentas de estimativa de risco podem ser utilizadas na prática clínica para promover o aconselhamento, prevenção, ou aumentar a vigilância contra o desenvolvimento do câncer de mama. O presente estudo teve como objetivo estimar o risco de câncer de mama e a probabilidade de risco para mutação BRCA1/2, e correlacionar os valores encontrados pelos diferentes modelos. O risco de desenvolvimento do Câncer de mama foi estimado pelos modelos de Gail, Claus, BRCAPRO e Boadicea, e para as mutações, os modelos Boadicea Myriad II, Penn II BRCAPRO foram utilizados, em mulheres que têm ou tiveram a doença (n = 16) e seu respectivos parentes de primeiro grau do sexo feminino afetados (n = 25). Considerando-se as mulheres não afetadas 16% foram categorizadas como de alto risco para o desenvolvimento de câncer de mama em cinco anos pelo modelo de Gail, e todos os valores apresentaram correlação significativa entre os modelos (p < 0,05). Entre as participantes, 12% (5/41) foram consideradas de alto risco para mutações dos genes BRCA. Todos os modelos apresentaram correlação significativa entre as probabilidades de risco para a mutação BRCA1/2, exceto entre os modelos Boadicea Myriad e II. Uma vez que não existe um modelo que inclui todas as variáveis que influenciam o desenvolvimento da doença, é essencial estimar o risco por mais de um modelo antes do início de qualquer intervenção clínica.


Subject(s)
Humans , Female , Genetic Variation , Breast Neoplasms , Risk Factors
17.
Rev. Soc. Bras. Med. Trop ; 45(3): 297-300, May-June 2012. graf, mapas, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-640423

ABSTRACT

INTRODUCTION: The precise identification of the genetic variants of the dengue virus is important to understand its dispersion and virulence patterns and to identify the strains responsible for epidemic outbreaks. This study investigated the genetic variants of the capsid-premembrane junction region fragment in the dengue virus serotypes 1 and 2 (DENV1-2). METHODS: Samples from 11 municipalities in the State of Paraná, Brazil, were provided by the Central Laboratory of Paraná. They were isolated from the cell culture line C6/36 (Aedes albopictus) and were positive for indirect immunofluorescence. Ribonucleic acid (RNA) extracted from these samples was submitted to the reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and nested PCR. RESULTS: RT-PCR revealed that 4 of the samples were co-infected with both serotypes. The isolated DENV-1 sequences were 95-100% similar to the sequences of other serotype 1 strains deposited in GenBank. Similarly, the isolated DENV-2 sequences were 98-100% similar to other serotype 2 sequences in GenBank. According to our neighbor-joining tree, all strains obtained in this study belonged to genotype V of DENV-1. The DENV-2 strains, by contrast, belonged to the American/Asian genotypes. CONCLUSIONS: The monitoring of circulating strains is an important tool to detect the migration of virus subtypes involved in dengue epidemics.


INTRODUÇÃO:A identificação precisa da variante genética do vírus da dengue é importante para compreender a dispersão, virulência e identificação das cepas responsáveis pelas epidemias. O objetivo da pesquisa foi investigar a variação genética do fragmento da junção do gene capsídeo/pré-membrana dos sorotipos 1 e 2. MÉTODOS: Amostras de onze municípios do Estado Paraná, Brasil, foram cedidas pelo Laboratório Central do Paraná e consistiam em isolados de cultura de células da linhagem C6/36 (Aedes albopictus), positivos para técnica de imunofluorescência indireta. O Ribonucleic acid (RNA) dessas amostras foi extraído, seguido da transcrição reversa, reação em cadeia da polimerase (PCR) e nested PCR. RESULTADOS: Co-infecção por DENV-1 e 2 (virus da dengue 1 e 2) foi observada em quatro pacientes, através da técnica Reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Para o DENV-1 a porcentagem de similaridade variou de 95 a 100% comparando com cepas do Genbank. Para o DENV-2 a porcentagem de similaridade variou de 98 a 100%. De acordo com o cladograma gerado, todas as cepas deste estudo se agruparam no genótipo V para DENV-1. Para o DENV-2 foi encontrada a cepa referente ao genótipo asiático/americano. CONCLUSÕES: O monitoramento das cepas circulantes torna-se uma ferramenta importante na detecção da migração dos subtipos do vírus da dengue envolvidos em epidemias.


Subject(s)
Animals , Humans , Capsid Proteins/genetics , Dengue Virus/genetics , Genetic Variation/genetics , Aedes/virology , Brazil , Dengue Virus/classification , Dengue Virus/isolation & purification , Fluorescent Antibody Technique, Indirect , Genotype , Polymerase Chain Reaction , Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction , RNA, Viral/genetics
18.
An. bras. dermatol ; 87(1): 127-130, Jan.-Feb. 2012. ilus
Article in English | LILACS | ID: lil-622461

ABSTRACT

In dystrophic epidermolysis bullosa, the genetic defect of anchoring fibrils leads to cleavage beneath the basement membrane and its consequent loss. A 46 year-old female patient presented blisters with a pretibial distribution associated with nail dystrophy. Her two children had hyponychia and anonychia, which affected all toe nails and the thumb, forefinger and middle finger. DNA sequencing identified in exon 75 of COL7A1 gene a pathologic mutation: c.6235G>A (p.Gly2079Arg). Immunomapping of a blister demonstrated collagen IV (basal membrane) in the blister roof and collagen VII in its floor, confirming dystrophic epidermolysis bullosa. Scanning electron microscopy of an inverted blister showed net-forming collagen attached to the blister roof . The variability found in this family has already been reported and confirms, on a clinical basis, the nail subtype as a dystrophic variant.


Na epidermólise bolhosa distrófica, o defeito genético das fibrilas de ancoragem leva à clivagem abaixo da membrana basal com sua consequente perda. Uma paciente de 46 anos apresentava bolhas pré-tibiais associadas à distrofia ungueal. Seus dois filhos apresentavam hipo e anoníquia, afetando todas as unhas dos pododáctilos e dos primeiros, segundos e terceiros quirodáctilos. O sequenciamento de DNA identificou no exon 75 do gene COL7A1 uma mutação patológica: c.6235G>A (p.Gly2079Arg). O imunomapeamento identificou o colágeno IV no teto e colágeno VII no assoalho de uma bolha , confirmando o diagnóstico de epidermólise bolhosa distrófica. A microscopia eletrônica de varredura de um teto invertido de bolha demonstrou rede de colágeno aderida ao mesmo. A variabilidade clínica encontrada nessa família já foi escrita e confirma, que o subtipo ungueal das epidermólises bolhosas é uma forma distrófica.


Subject(s)
Child , Female , Humans , Middle Aged , Epidermolysis Bullosa Dystrophica/genetics , Epidermolysis Bullosa Dystrophica/pathology , Blister/pathology , Microscopy, Electron, Scanning , Nail Diseases/genetics , Nail Diseases/pathology
19.
An. bras. dermatol ; 86(6): 1222-1227, nov.-dez. 2011. ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-610438

ABSTRACT

A paquioníquia congênita é uma rara genodermatose da ceratinização, primeiramente descrita em 1906 por Jadassohn e Lewandowsky. Além de pouco conhecida, a variabilidade fenotípica e as formas oligossintomáticas dificultam o diagnóstico. Relatamos uma família com três gerações afetadas, até recentemente sem diagnóstico. A busca ativa por casos familiares em pacientes com quadro suspeito e a identificação de manifestações peculiares de seus subtipos, como esteatocistoma múltiplo, permitem diagnóstico clínico precoce. Além disso, oportunizam a orientação familiar e de prognóstico ao portador.


Pachyonychia Congenita is a rare genodermatosis of keratinization, first described in 1906 by Jadassohn and Lewandowsky. Besides not being well known, phenotypic variability and oligosymptomatic subtypes make the diagnosis difficult. We report a family with three generations affected, until recently not diagnosed. The active search for familial cases in patients with suspicious manifestations and identification of peculiar characteristics of its subtypes, as multiplex steatocystoma, provide early clinical diagnosis. In addition, nurture the family counseling and informations about prognosis.


Subject(s)
Female , Humans , Middle Aged , Leiomyoma/pathology , Skin Neoplasms/pathology , Uterine Neoplasms/pathology , Leiomyomatosis/pathology , Syndrome
20.
Cad. saúde pública ; 27(9): 1859-1863, set. 2011.
Article in English | LILACS | ID: lil-600782

ABSTRACT

This study constitutes a first attempt to describe the genetic population structure of Mycobacterium tuberculosis circulating in Salvador, Bahia State, Brazil. A total of 56 confirmed cases of pulmonary tuberculosis, identified between March and June 2008, were analyzed using restriction fragment length polymorphism (IS6110-RFLP). The study population was characterized by a predominance of males (71.43 percent) over 30 years of age (68.75 percent). Forty-one isolates were found to belong to a single pattern (73.2 percent), while 15 (26.7 percent) were found in group patterns, forming six clusters. The higher level of diversity observed is much more suggestive of endogenous reactivation than recent transmission.


Este é o primeiro estudo realizado na Bahia, Brasil, visando à descrição da estrutura da população genética circulante do Mycobacterium tuberculosis na cidade de Salvador. Um total de 56 casos confirmados de tuberculose pulmonar, identificados entre março e junho de 2008, foi analisado pelo método Restriction Fragment Lenght Polymorphism (IS6110-RFLP). A população de estudo foi caracterizada como a maioria do sexo masculino (71,43 por cento), idade acima de 30 anos (68,75 por cento). Quarenta e um isolados (73,21 por cento) com padrão único, enquanto 15 (26,75 por cento) apresentaram padrões agrupáveis, formando seis clusters. A alta taxa de diversidade das cepas de M. tuberculosis observada é mais sugestiva de reativação endógena do que transmissão recente.


Subject(s)
Adult , Female , Humans , Male , Young Adult , Genetic Variation , Mycobacterium tuberculosis , Tuberculosis, Pulmonary , Age Distribution , Brazil , Polymorphism, Restriction Fragment Length , Sex Distribution , Tuberculosis, Pulmonary
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